Endless OSはLinuxベースのオペレーティングシステムで、特定のアプリケーションや機能がWindowsと異なる場合があります。例えば、Windowsで利用可能な一部の専用ソフトウェアやゲームは、Endless OSではネイティブには動作しない可能性があります。また、Endless OSはイミュータブルなシステムであるため、システムファイルや設定の変更が制限されています。
一方で、多くの一般的なアプリケーションはEndless OSのApp Centerを通じて利用可能です。例えば、ZoomはApp Centerからインストール可能です。しかし、Windowsで利用されている一部のアプリケーションには、Endless OSでの代替品が必要になるかもしれません。例として、Microsoft Officeは直接は利用できませんが、LibreOfficeなどのオープンソースのオフィススイートが利用可能です。
Endless OSで利用できるアプリケーションの例としては、Krita（ペインティングアプリ）や、Evolution（メーラー）などがあります。また、Endless OSは教育やクリエイティブな活動に特化しており、多くの教育関連のアプリケーションがプリインストールされています。
Webサービスに関しては、基本的にはブラウザを通じてアクセスするため、WindowsとEndless OSの間で大きな違いはありません。ただし、特定のブラウザ拡張機能やプラグインがEndless OSでサポートされていない可能性があるため、その点は注意が必要です。
